DNA-Barcode Abgleich

Hier haben Sie die Möglichkeit eine oder mehrere DNA-Barcodes (derzeit COI) gegen die GBOL Barcode Daten abzugleichen, um zu einer Bestimmung ihrer unbekannten Probe zu gelangen. Bitte kopieren Sie dazu den Inhalt einer FASTA-Datei in das Suchfeld.


Eine oder mehrere Nukleotid Sequenzen im FASTA format.

Parameter für die Suche (GBOL Datenbank)
Suche
BLAST-Programm, welches zur Suche verwendet werden soll.



Erwartungswert für das Speichern der gefundenen Sequenzen.



Belohnungs- und Strafkosten für passende und nicht passende Nukleotide.


Strafkosten für Öffnung bzw. Erweiterung von Gaps während des Sequenzabgleichs.
Parameter für Ergebnisse

Hier können Sie einstellen, wie viele Treffer Sie pro Suchanfrage maximal zurückbekommen möchten und wie restriktiv ihre Suche sein soll. Je höher der eingestellte Wert bei Prozent Übereinstimmung ist, desto weniger Treffer erhalten Sie.



Maximale Anzahl der zurückgegebenen Treffer (>1).



In der Ergebnisliste werden nur solche Treffer ausgegeben deren Übereinstimmung mit der Abfrage größer als der gewählte Wert ist. Eine Artbestimmung über den DNA-Barcode Abgleich ist in der Regel bei einer Übereinstimmung ab 98% als robust und ab 99% als zuverlässig anzusehen. Bitte kontaktieren Sie uns wenn Sie Hilfe bei der Interpretation der Ergebnisse benötigen.